Ao nível internacional, representa Colômbia Feminino Sub-17. A sua principal função em campo é Médio.

Em 1 presenças em CONMEBOL Sudamericano Feminino Sub-17 2025, Vanessa Leonor Puerta contribuiu com 0 golos e 1 assistências, completou 0 passes-chave em 11 passes totais e registou uma precisão de passe de 3.