Ao nível internacional, representa Burquina Faso Sub-17. A sua principal função em campo é Médio.

Em 6 presenças em Campeonato do Mundo FIFA de Sub-17 2025, Mohamed Fofana contribuiu com 0 golos e 0 assistências, completou 0 passes-chave em 49 passes totais e registou uma precisão de passe de 6.