Está inscrito no FK Žalgiris Vilnius e usa a camisola número 14. A sua principal função em campo é Defesa.

Ao longo de Liga Jovem da UEFA 2024-2025, Martynas Šetkus participou em 2 jogos e teve médias de 5.5 desarmes, 1.5 intercepções, 1.5 alívios e 0 remates bloqueados por jogo.